Misión

Contribuir a la reducción de las enfermedades infecciosas fomentando el desarrollo humano a través de la investigación de excelencia, el perfeccionamiento y evaluación  de técnicas de diagnóstico, vacunas y tratamientos, la formación de recursos humanos y la vinculación con la comunidad.

Visión

El CISEI será reconocido, nacional e internacionalmente, como un centro de excelencia en investigación, desarrollo tecnológico, enseñanza y vinculación enfocado a las enfermedades infecciosas prioritarias en Salud Pública.